新疆医科大学附属肿瘤医院胸外科二病区是国家癌症中心肺癌和食管癌诊疗质控试点单位、新疆维吾尔自治区胸外科质量控制中心所在专科，是新疆维吾尔自治区临床重点专科。现设置床位61张，拥有主任医师4名、副主任医师3名、主治医师1名、住院医师4名，以及副主任护理师2名，其中博士学位3人，硕士学位9人，硕士研究生导师5人。

科室坚持开展手术患者术前MDT讨论，完善术前评估，综合制定手术方式及治疗方案，保障医疗安全，注重优质服务。在疆内率先开展胸腔镜下的食管癌根治术、纵隔肿瘤切除术、肺癌根治术、肺段切除术、联合肺亚段切除术、支气管袖状切除术、全肺切除术，常规开展胸壁巨大肿物切除及胸壁重建手术、气管肿瘤切除、隆突切除重建、支气管/肺动脉袖状切除术、复杂纵隔肿瘤切除等一系列高难度手术，已开展机器人精准微创手术超过300台以上，目前年手术量1300台以上，其中微创手术率及四级手术率达90%以上，技术实力雄厚，业务水平及业务量处于疆内领先、国内一流水平。