乳腺甲状腺外科是我院深受患者信任的品牌科室，设乳腺和甲状腺两个外科病区，在乳腺癌和甲状腺癌早诊早治方面做出的卓越贡献及精湛的手术技术享誉疆内外。科室现有66名医护工作者，党员32人，博士生导师1人、硕士生导师3人、主任医5师人、副主任医师5人、主治医师9人、住院医师3人、在读博士、硕士研究生10余人。

科室主任马斌林教授为我院乳腺癌和甲状腺癌首席专家，学科带头人，主任医师、博士生导师，医科大学“双带头人”，新疆医学会肿瘤专业委员会主任委员，新疆抗癌协会理事长，新疆肿瘤研究所乳癌研究中心主任，自治区乳腺癌质控中心主任。获得“全国先进工作者”“全国五一劳动奖章”、“全国白求恩式好医生”、“国务院特贴专家”等荣誉称号。他领衔的团队均拥有博士或硕士学历背景，专业和卓尔不群的优质服务，为生命高质量追求完美治疗的多学科协作诊疗模式和全方位全过程的患者管理理念得到了社会广泛赞誉。

经治的乳腺癌和甲状腺癌患者的5年生存率均高于全国平均水平。乳腺良性肿瘤微创旋切手术、乳腺癌保乳术、乳腺癌术后乳房自体或异体植入重建手术以及全腔镜辅助下甲状腺癌根治术均在疆内处于领先水平，尤其疆内率先开展的腔镜辅助下经口腔甲状腺手术，陆续又开展多项多途径腔镜辅助下甲状腺手术、达芬奇机器人、射频消融等为女性患者带来术后无疤痕美容效果。卓越的诊疗技术吸引了众多疆内外及俄罗斯等周边中亚国家患者前来就医。

近五年主持国家级及自治区科研项目共20项，获“自治区科技进步二等奖”2项，“自治区科技进步三等奖”2项，“新疆医学会技术进步三等奖”1项；在SCI国际期刊、国家级和省级核心期刊发表论文两百余篇，专著3部，参编教材1部。